“準(zhǔn)確、快速、便利、安全”
這是我們對工作站的要求按優(yōu)先級排序。
但“紙上談兵”終覺淺,絕知此“站”要躬行。
對此類產(chǎn)品客戶往往有一個(gè)最大的擔(dān)心——
用設(shè)備去做是否會出現(xiàn)假陽性(不同樣本的交叉污染)
為讓客戶更放心,于是我們著手深入自動化工作站測試工作,此次友康測試了真正的病毒樣本(正規(guī)渠道購自國家機(jī)構(gòu),無傳染能力),友康全自動核酸提取儀FE4800首次實(shí)地“試飛”圓滿成功!
一:背景知識
為什么可能會出現(xiàn)樣本的交叉污染?
——出現(xiàn)交叉污染的原因在于采樣管之間的距離,以及深孔板不同孔板之間的距離較短。以及設(shè)備轉(zhuǎn)移液體過程中,不可避免會產(chǎn)生氣溶膠。一個(gè)樣本的氣溶膠,如果落入另外一個(gè)樣本中,就會產(chǎn)生樣本的交叉污染。我們的設(shè)備可以在一個(gè)時(shí)間點(diǎn)同時(shí)處理8個(gè)樣本,客戶有疑惑很正常。
這種交叉污染為什么必須要避免?
——不是所有的交叉污染都會產(chǎn)生嚴(yán)重后果,但分子領(lǐng)域的交叉污染確實(shí)會產(chǎn)生極為嚴(yán)重的后果,原因在于在后端的檢測原理是多次復(fù)制初始的樣本。以目前臨床檢測陽性陰性分界線的CT值為35來計(jì)算,即初始樣本需復(fù)制2的35次方倍。即640億倍。初始一個(gè)核酸,經(jīng)過擴(kuò)增可擴(kuò)增至640億個(gè)核酸。是驚人的。所以,樣本只要被別的樣本污染,結(jié)果錯(cuò)誤是不可避免。
二:實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/strong>
對友康全自動樣本處理與核酸提取工作站的使用性能做出系統(tǒng)的評價(jià),驗(yàn)證該設(shè)備正常提取過程中,無氣溶膠污染的問題出現(xiàn)。
三:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
1、 為考驗(yàn)本提取設(shè)備在較為極端的條件下是否會存在交叉污染的情況,采用較多的強(qiáng)陽性樣本與陰性樣本進(jìn)行交錯(cuò)擺放,并進(jìn)行3個(gè)批次的重復(fù)實(shí)驗(yàn)。
2、 一批提取48個(gè)樣本,設(shè)置其中27個(gè)為含病毒樣本,同時(shí)設(shè)置21個(gè)無病毒樣本。
3、 陽性樣本的病毒濃度為109 copies/mL。(參考臨床實(shí)際陽性樣本濃度上限)
4、 帶有病毒的樣本與空樣本之間交叉間隔擺放,同時(shí)設(shè)置陽性樣本圍繞陰性樣本(下表中的陰-6樣本)以及陰性樣本圍繞陽性樣本(下表中的2-1樣本)的情況,具體擺放順序如下:
陰性樣本與陽性樣本具體布局。
陰 | 陰 | 陰 | 陽 | 陰 | 陽 | 陰 | 陽 |
陰 | 陽 | 陰 | 陽 | 陰 | 陽 | 陰 | 陽 |
陰 | 陰 | 陰 | 陽 | 陽 | 陰 | 陽 | 陰 |
陽 | 陽 | 陽 | 陽 | 陽 | 陽 | 陽 | 陰 |
陽 | 陰 | 陽 | 陽 | 陽 | 陰 | 陽 | 陽 |
陽 | 陽 | 陽 | 陽 | 陰 | 陰 | 陰 | 陰 |
四:操作步驟
1、 病毒液的配制。
2、 病毒樣本的加入。將病毒液以1:9的體積比例加入至采樣管中。共設(shè)置27個(gè)含有病毒的采樣管,分別標(biāo)記序號,并做好記錄。每個(gè)采樣管中折斷一個(gè)拭子進(jìn)去。充分振蕩 混勻。
3、 儀器所需試劑的配制。共需要三種試劑,分別為異丙醇與磁珠的混合液15.36mL(包含14.4mL的異丙醇與960μL的磁珠)、純化液38.4mL和洗脫液4.8mL。
4、 將27管按照從左向右,從上向下的順序依次插入預(yù)先設(shè)定好的孔位,將無病毒樣本的陰性對照管插入剩余的21個(gè)孔中,啟動程序,進(jìn)行提取。
5、 進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄熒光定量PCR檢測,檢測21個(gè)陰性樣本,同時(shí)設(shè)置一個(gè)含有病毒核酸的孔作為陽性對照。
6、 實(shí)驗(yàn)進(jìn)行3批重復(fù)。
五:實(shí)驗(yàn)結(jié)果
1、第一批次各組擴(kuò)增曲線如下:
注:只有陽性對照組出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,陰性對照和其余各組均沒有擴(kuò)增出來。
數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì):
組別 | Ct值 | 組別 | Ct值 | 組別 | Ct值 |
陰-1 | NoCt | 陰-8 | NoCt | 陰-15 | NoCt |
陰-2 | NoCt | 陰-9 | NoCt | 陰-16 | NoCt |
陰-3 | NoCt | 陰-10 | NoCt | 陰-17 | NoCt |
陰-4 | NoCt | 陰-11 | NoCt | 陰-18 | NoCt |
陰-5 | NoCt | 陰-12 | NoCt | 陰-19 | NoCt |
陰-6 | NoCt | 陰-13 | NoCt | 陰-20 | NoCt |
陰-7 | NoCt | 陰-14 | NoCt | 陰-21 | NoCt |
陽性對照 | 27.95 | 陰性對照 | NoCt |
2、第二批次各組擴(kuò)增曲線如下:
注:只有陽性對照組出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,陰性對照和其余各組均沒有擴(kuò)增出來。
數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì):
組別 | Ct值 | 組別 | Ct值 | 組別 | Ct值 |
陰-1 | NoCt | 陰-8 | NoCt | 陰-15 | NoCt |
陰-2 | NoCt | 陰-9 | NoCt | 陰-16 | NoCt |
陰-3 | NoCt | 陰-10 | NoCt | 陰-17 | NoCt |
陰-4 | NoCt | 陰-11 | NoCt | 陰-18 | NoCt |
陰-5 | NoCt | 陰-12 | NoCt | 陰-19 | NoCt |
陰-6 | NoCt | 陰-13 | NoCt | 陰-20 | NoCt |
陰-7 | NoCt | 陰-14 | NoCt | 陰-21 | NoCt |
陽性對照 | 28.55 | 陰性對照 | NoCt |
3、第三批次各組擴(kuò)增曲線如下:
注:只有陽性對照組出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,陰性對照和其余各組均沒有擴(kuò)增出來。
數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì):
組別 | Ct值 | 組別 | Ct值 | 組別 | Ct值 |
陰-1 | NoCt | 陰-8 | NoCt | 陰-15 | NoCt |
陰-2 | NoCt | 陰-9 | NoCt | 陰-16 | NoCt |
陰-3 | NoCt | 陰-10 | NoCt | 陰-17 | NoCt |
陰-4 | NoCt | 陰-11 | NoCt | 陰-18 | NoCt |
陰-5 | NoCt | 陰-12 | NoCt | 陰-19 | NoCt |
陰-6 | NoCt | 陰-13 | NoCt | 陰-20 | NoCt |
陰-7 | NoCt | 陰-14 | NoCt | 陰-21 | NoCt |
陽性對照 | 29.72 | 陰性對照 | NoCt |
六:實(shí)驗(yàn)結(jié)論
同一批提取檢測中,陰性樣本與陽性樣本交叉擺放,結(jié)果陰性樣本孔均檢出,陽性對照孔正常檢出。說明本設(shè)備可以有效避免樣本間交叉污染的問題出現(xiàn)。
寫在后面:
目前市場上所有的核酸自動化工作站,我們選擇成為為數(shù)不多為用戶提供設(shè)備使用樣本的實(shí)測數(shù)據(jù)的供應(yīng)商。之后我們會繼續(xù)進(jìn)行多批次多樣本的測試,以確保該設(shè)備確實(shí)能夠滿足客戶的需求。讓我們一起拭目以待!